抗體是生物化學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)和免疫學(xué)實(shí)驗(yàn)室的重要檢測(cè)工具。鑒于用于無(wú)數(shù)應(yīng)用的抗體和抗體片段種類繁多,有時(shí)找到合適的抗體和抗體片段是一項(xiàng)艱巨的任務(wù),更不用說(shuō)可能危及抗體依賴性實(shí)驗(yàn)的廣泛?jiǎn)栴}。交叉反應(yīng)性、批次間差異以及在未經(jīng)測(cè)試的應(yīng)用中使用抗體等常見(jiàn)原因被認(rèn)為是導(dǎo)致結(jié)果不一致的原因。在這里,我們分享了一些實(shí)驗(yàn)室到實(shí)驗(yàn)室的技巧,以選擇您研究目的的抗體。
定義您的蛋白質(zhì)靶標(biāo) – 了解蛋白質(zhì)靶標(biāo)的生物學(xué)特性,因?yàn)榈鞍踪|(zhì)靶標(biāo)可能非常復(fù)雜,并且與相關(guān)蛋白質(zhì)的序列同一性或同源性可能會(huì)產(chǎn)生潛在的交叉反應(yīng)性。使用 GeneCards 等數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)識(shí)別抗原的命名法和任何替代名稱,并使用 UniProt 獲得目標(biāo)蛋白質(zhì)的氨基酸序列。
選擇正確的應(yīng)用程序 – 選擇與您的研究最匹配的應(yīng)用程序。這取決于您需要回答研究問(wèn)題的數(shù)據(jù)類型。例如,Western blot 是研究蛋白質(zhì)濃度的應(yīng)用;免疫組織化學(xué)和免疫細(xì)胞化學(xué)用于研究定位,因?yàn)樗鼈兣c固定的細(xì)胞和組織一起工作;而 ELISA、FACS 和流式細(xì)胞術(shù)是研究蛋白質(zhì)相互作用和表達(dá)的合適技術(shù)。
確??贵w適合您的樣品 – 由于靶標(biāo)的序列和結(jié)構(gòu)因物種而異,因此請(qǐng)使用已針對(duì)您感興趣的物種專門驗(yàn)證的抗體。在這種情況下,請(qǐng)相信數(shù)據(jù)表:如果抗體已針對(duì)一種物種進(jìn)行了驗(yàn)證,則無(wú)法保證它對(duì)其他物種有效。
選擇兼容的抗體 – 不應(yīng)假設(shè)已證明可在一種應(yīng)用中檢測(cè)靶標(biāo)的抗體在其他應(yīng)用中也能檢測(cè)到靶標(biāo)。免疫化學(xué)應(yīng)用依賴于使用敏感和高度特異性的抗體。更具體地說(shuō),它們?nèi)Q于抗原識(shí)別靶蛋白的能力。為了實(shí)現(xiàn)有效的抗原-抗體相互作用,表位必須易于結(jié)合。有時(shí)抗原可能需要靶蛋白以天然和折疊形式存在,或以變性形式存在。
通過(guò)固定、pH 值變化或在凝膠電泳制備過(guò)程中,表位可能會(huì)發(fā)生變化,這可能會(huì)影響其與抗體相互作用的能力。例如,在 IHC 研究中,抗體可以識(shí)別冰凍組織切片中的表位,但該表位可能無(wú)法在已變性以進(jìn)行 Western 印跡分析的樣品中獲得。
選擇宿主物種 – 通常,建議避免使用與目標(biāo)樣品物種相同的宿主抗體物種,以避免干擾免疫球蛋白。選擇宿主物種時(shí),請(qǐng)考慮針對(duì)一抗的宿主物種產(chǎn)生的二抗,并根據(jù)應(yīng)用進(jìn)行選擇。
研究產(chǎn)品數(shù)據(jù)表并準(zhǔn)備好優(yōu)化您的方案 – 產(chǎn)品數(shù)據(jù)表通常包含許多重要細(xì)節(jié),包括免疫原的描述、表位的性質(zhì)、宿主物種、交叉反應(yīng)性和推薦的起始稀釋度。因此,在設(shè)置方案時(shí)需要考慮許多因素,例如封閉緩沖液、抗體稀釋劑、孵育步驟的長(zhǎng)度和檢測(cè)方法。所有這些額外的細(xì)節(jié)將幫助您優(yōu)化實(shí)驗(yàn)方案以實(shí)現(xiàn)成功的分析。
始終包括實(shí)驗(yàn)對(duì)照 – 在規(guī)劃實(shí)驗(yàn)時(shí),對(duì)照是有助于了解結(jié)果是成功還是失敗的關(guān)鍵部分。大多數(shù)常見(jiàn)的實(shí)驗(yàn)技術(shù)需要特定的控制來(lái)幫助解釋數(shù)據(jù)。例如,Western 印跡應(yīng)始終包含上樣對(duì)照,而 IHC 和 IF 應(yīng)始終具有多個(gè)陰性對(duì)照,以幫助區(qū)分信號(hào)與背景噪音。
陽(yáng)性對(duì)照的示例可能包括重組蛋白或由已知可產(chǎn)生可檢測(cè)靶標(biāo)水平的細(xì)胞系制備的裂解物;而陰性對(duì)照可能包括使用敲除樣品或省略一抗,這兩者都可以檢測(cè)到二抗引起的背景染色。
總之,盡管找到適用于特定應(yīng)用的抗體有時(shí)仍然是一項(xiàng)艱巨的任務(wù),但我們希望這些提示和指南能為您的搜索提供一些有用的起點(diǎn)。